溫度調控：通過制冷系統和加熱系統來調控柜內的溫度，使其保持在設定的低溫范圍內，通常溫度范圍可設定在0-10℃，且控溫精度可達±1℃。低溫環境能夠降低種子的代謝速率，減少養分消耗，使種子處于休眠狀態，從而延長其儲藏期。同時，低溫還能抑制貯藏庫內害蟲的生活繁殖和危害，避免種子受到蟲害。
濕度調控：通過除濕系統和加濕系統來調控柜內的濕度，使其保持在設定的低濕度范圍內，一般濕度范圍控制在60%RH以下，控濕精度可達±5%RH。低濕環境能夠防止種子吸收空氣中的水分，減少霉變和蟲蛀的風險。
智能控制系統：采用全微電腦自動化設定控制箱內溫度、濕度、時間等指標，確保儲藏環境的穩定性和安全性。控制系統具有除霜、延時、超溫報警、自動除濕、時差糾正、紫外殺菌等功能。例如，當溫度超過設定范圍時，系統會自動報警并采取措施進行調整；同時，紫外殺菌功能可以有效殺滅柜內的微生物，保證種子的衛生安全。
安全保護功能：具備多重安全保護功能，如開門超時報警、溫度超限報警、傳感器故障報警、漏電保護、超溫保護、壓縮機過載保護、電流過載保護等，確保設備和樣品的安全。
節能環保設計：采用高效制冷結構和風冷式不結霜設計，減少能耗和化霜次數。設備自帶掉電記憶功能，斷電后再次開機可自動恢復原來的工作狀態。